Sebanyak 4 program studi di FMIPA UNY memperoleh akreditasi unggul dari Lembaga Akreditasi Mandiri Kependidikan (LAMDIK). Prodi tersebut adalah S1 Pendidikan IPA, S1 Pendidikan Biologi, S2 Pendidikan Kimia, S2 Pendidikan Fisika. Akreditasi berlaku dari 2025-2030. 
Dekan FMIPA, Prof. Dr. Dadan Rosana, M.Si., mengatakan ini adalah hasil kerja keras dari Prodi maupun Fakultas yang telah mempersiapkan borang akreditasi.  Tahun  ini FMIPA UNY ada 11 Prodi yang melakukan re-akreditasi dan ada 4 yang sudah keluar hasilnya dari LAMDIK yaitu terakredirasi unggul. 

Sumbaji Putranto dari program studi Pendidikan Matematika S3 berhasil mempertahankan Disertasi dihadapan para penguji.  Sumbaji mengajukan Rekognisi Pembelajaran Lampau terhadap 2 Jurnal Scopus ke Universitas Negeri Yogyakarta dan telah diterima melalui Surat Keputusan Rektor Nomor 1.19/UN34/IX/2024 tanggal 19 September 2024 yang menetapkan dirinya bebas ujian terbuka. Selama kuliah Sumbaji memperoleh IPK 4,00 dan menyelesaikan masa studi selama 35 bulan (2 tahun 11 bulan), sehingga lulus dengan predikat Dengan Pujian Tertinggi (Summa Cum Laude).

National Creative Competition #2 merupakan ajang tahunan yang menjadi ruang ekspresi dan unjuk kemampuan mahasiswa dari berbagai perguruan tinggi di Indonesia. Melalui kompetisi ini, FMIPA UNY berupaya mendorong lahirnya karya-karya inovatif di bidang sains, teknologi, dan pendidikan. NCC #2 mengusung tema “Eco-Friendly lifestyle:Reduce, Reuse, Recycle (3R), Innovation for ecosystem. Tahun kedua ini NCC diikuti oleh total 242 tim dari 85 universitas di seluruh Indonesia. Peserta ini terdiri dari 46 tim peserta lomba video pendek dan 196 peserta infografis.

FMIPA UNY melaksanakan studi dan observasi terkait proses pengembangan anggrek kerdil sebagai upaya untuk menghasilkan varietas-varietas baru anggrek forma Bali dengan Badan Riset dan Inovasi Daerah (BRIDA) dan Lembaga Penelitian dan Pengabdian kepada Masyarakat Universitas Udayana Bali.